Pelate le cipolle e tagliatele a fettine sottili.

Fate sciogliere il burro in un tegame, aggiungete le cipolle e fatele appassire con coperchio per 10-15 minuti, quindi aggiungete la farina setacciata e mescolate.

Fate incorporare per bene la farina, quindi aggiungete il brodo e lasciate cuocere per almeno 30 minuti con coperchio a fiamma medio-bassa.
Togliete il coperchio, aggiustate di sale e pepe e lasciate asciugare fino ad ottenere una zuppa densa.

Trasferite la zuppa nelle cocotte adatte alla cottura in forno e lasciate raffreddare, quindi coprite con un foglio di pasta sfoglia ritagliato su misura (fatelo aderire bene ai bordi).
Bucherellate la sfoglia e cuocete per 15 minuti in forno ventilato preriscaldato a 180°C.

La zuppa di cipolle in crosta è pronta, lasciatela riposare per qualche minuto prima di servirla.